一次性医用无菌口罩，即不允许细菌存在。一次性医用非无菌口罩即没有完全消灭细菌，在符合微生物控制标准的前提下，允许一定量细菌存在。非无菌口罩只能有阻隔飞沫，防尘防霾的作用，但非无菌口罩在医院使用较多。
1.灭菌程度
灭菌程度是一次性口罩无菌与非无菌的区别之一，虽然两者都是在无菌车间生产的，但是无菌型口罩的灭菌程度和标准会远远大于非无菌型，且生产灭菌口罩车间的无菌级别会高于非无菌型。
2.微生物指标
无菌型口罩和非无菌型口罩都属于一次性医用口罩，都是按照YY/T0969的规定生产的，但是两者对口罩的微生物指标也有所不同，无菌型口罩要求无菌，而非无菌型口罩只是对微生物有限度要求。
3.用途
非无菌一次性以用口罩通常指的是普通的防尘口罩，这种口罩在工厂车间使用的比较多，平时遇到雾霾天或大风天气，也可以佩戴这种口罩进行防护，而无菌口罩在医院使用的比较多。
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